MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017816	TGG	2	6	839	844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017816	AGT	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017816	TA	3	6	879	884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017816	AAT	2	6	889	894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017816	AT	3	6	961	966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017816	AT	3	6	987	992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017816	TAT	2	6	1000	1005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017816	TTAA	2	8	1039	1046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017816	A	6	6	1081	1086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017816	A	6	6	1126	1131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017816	TAA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017816	ATA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017816	ATTTTT	2	12	1263	1274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017816	ATT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017816	T	6	6	1325	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017816	A	8	8	1352	1359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017816	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017816	AGG	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017816	GAA	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017816	TAT	2	6	2502	2507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017816	TAA	2	6	2524	2529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017816	AT	3	6	2532	2537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017816	GAT	2	6	2543	2548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017816	T	7	7	2599	2605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017816	TTGT	2	8	2622	2629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017816	TAA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017816	TG	4	8	2651	2658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017816	TAT	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017816	ATTT	2	8	2692	2699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017816	TG	4	8	2702	2709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017816	TAA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017816	A	8	8	2787	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017816	GAGAA	2	10	2801	2810	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017816	CTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017816	AAG	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017816	TTA	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017816	ACC	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017816	CTC	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017816	CTG	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017816	CTA	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017816	AAAT	2	8	3092	3099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017816	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017816	TTAT	2	8	3158	3165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017816	AAG	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017816	ATTA	2	8	3211	3218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017816	TTAC	2	8	3258	3265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.